Las prestaciones de ambos gestores son bastante similares por lo que, optar por uno u otro, depende mucho de las preferencias personales de cada uno. Mendeley tiene más opciones como red social, permitiendo formar grupos y redes de contactos con otros investigadores, en los que poder llevar a cabo discusiones acerca de un tema, además de, compartir anotaciones y comentarios sobre documentos en formato pdf. También, permite la promoción de los trabajos propios, con la creación del perfil de investigador. Además, con esta versión institucional de Mendeley se permite  un gran almacenamiento personal (hasta 100 Gb) y un almacenamiento en grupos de trabajo, de hasta 100 miembros, de 100 Gb.

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